Die alte Universität befindet sich in den Gebäuden des alten Königspalais, die 1540 zu den "Paço dos Estudos" umgebaut wurden. Sie besitzt eine prachtvolle Bibliothek mit 30.000 Büchern und 5000 Manuskripten, die nach Fachgebieten geordnet sind. In der Kapelle im manuelinischen Stil ist ein schöner Orgelprospekt aus dem 18. Jh. zu sehen. Vom Balkon auf der Rückseite des Bauwerks hat man einen großartigen Blick über die Stadt. Seit 2013 gehört die Universität zum Weltkulturerbe der Unesco.