Das Evora Museum befindet sich im alten Bischofspalast (16. Jh.) und zeigt Kunstsammlungen und archäologische Sammlungen. Bemerkenswert sind der Kenotaph (16. Jh.) des Bischofs Afonso do Portugal, ein schöner Sarkophag aus Marmor von 1364, Gemälde von Francisco Henriques (Hofmaler des Königs Dom Manuel) und Gregório Lopes, bei denen man den Einfluss des Manierismus erkennbar ist. Unbedingt sehenswert sind auch die dreizehn Bildtafeln des ehemaligen flämischen Altaraufsatzes der Kathedrale.