Das Kirchenmuseum beherbergt Werke von großem historischem und künstlerischem Wert. Besondere Schätze sind der Schrein des Hl. Isidoro (11. Jh.), eine gold- und silberplattierte Holztruhe, der Kelch der Doña Urraca aus zwei römisch-orientalischen Onyxschalen und das emaillierte Kästchen (12. Jh.) aus 17 mit Email aus Limoges überzogenen Kupferplättchen. Die Bibliothek zählt 1055 alte und rare Buchbände vom 16. Jh. bis 18. Jh., 800 Pergamentdokumente, 400 Wiegendrucke, darunter eine mozarabische Bibel aus dem Jahr 960.