Das 7 ha große Areal an der Mündung des Mystic River ist Amerikas maritimer Vergangenheit des 19. Jh. gewidmet. In den mehr als 60 Gebäuden des Dorfes sind Werkstätten wie aus einer Hafenstadt des 19. Jh. untergebracht. Den Besucher erwarten hier handwerkliche Vorführungen rund um den Holzschiffsbau. Im Hafen liegen ein altes Dampfboot und drei große Schiffe vor Anker, darunter die Charles W. Morgan von 1841, ein Überbleibsel der amerikanischen Walfangflotte. Außerdem ist im Mystic Seaport die weltweit größte Sammlung kleiner Wasserfahrzeuge (mehr als 400 Fahrzeuge) zu sehen.