Der Yakushi-ji (680), der Haupttempel der Hosso-Sekte, ist einer der ältesten und heiligsten Tempel der Stadt. Er brannte 973 fast vollständig ab und wurde 1528 wieder aufgebaut mit Ausnahme der östlichen Pagode To-to. Die dreistöckige Pagode (34 m) scheint aufgrund der Zwischendächer sechs Stockwerke zu haben. In der Haupthalle Kon-do (1635) ist eine große, bronzene Yakushi-Triade (697) zu sehen, die durch den naturalistischen Stil der chinesischen Tang-Epoche beeinflusst ist. Das Prunkstück im östlichen Pavillon Toin-do (1285) ist eine indisch beeinflusste Sho Kannon aus dem 7. Jh.