Die alte Festung geht auf das 16. Jh. zurück. Im 17. Jh. wurde sie im Stil von Vauban in eine Zitadelle umgebaut. Stolz hält sie Wache mit ihren hohen, wehrhaften Mauern und scharfkantigen Bastionen, über denen kleine Wachtürme sitzen. Vor 1974 diente die Festung als Staatsgefängnis, dann als Auffanglager für Flüchtlinge aus Angola. Die Zitadelle von Peniche dominiert den Hafen im Osten und das Meer im Süden. In der capela Santa Bárbara befindet sich ein kleines Museum über die Geschichte der Zitadelle.