Das bedeutendste Museum für moderne Kunst San Franciscos befindet sich in einem fantastischen Gebäude von Mario Botta aus dem Jahr 1995, das wohlwollend über das ganze Yerba Buena Center for the Arts zu blicken scheint. Die beiden Einrichtungen sind das kreative Herz des Viertels. Der Entwurf Bottas ist eine beeindruckende Komposition aus symmetrischen, stufenförmigen, mit Backsteinen verkleideten Formen. In der Mitte des Gebäudes befindet sich ein riesiger Schaft, der sich von den Backsteinen durch Streifen aus schwarzen und weißen Steinen abhebt. Botta schuf ein riesiges Oberlicht, indem er den oberen Teil des Zylinders zur 3rd Street neigte und die Oberfläche verglaste. Dadurch ist das überwältigende Atrium mit Tageslicht durchflutet. Über 20.000 Kunstwerke repräsentieren alle wichtigen Kunstrichtungen der Moderne, mit besonderer Betonung auf der frühen Moderne und Arbeiten aus Kalifornien und der Gegend um San Francisco. Das Museum beherbergt auch bedeutende Sammlungen aus den Bereichen Fotografie, architektonische Modelle und Zeichnungen.