Der Eingang der Kirche San Francisco Javier befindet sich an der Seite der Fassade zur Plaza Hidalgo hin. Die Fassade ist ein Meisterwerk des Churriguerismus und wurde vom Architekten Ildefonso Iniesta entworfen und 1762 vollendet. Die Estípites bestimmen das Bild des Altars aus grauem Kalkstein, auf dem die wichtigsten Männer des Ordens auf einer außergewöhnlichen Steinplatte aufgereiht sind.