Die 1253 geweihte, imposante Basilika zeugt von der Entwicklung der Franziskaner hin zu mehr Prachtentfaltung und Ausschmückung unter dem Einfluss von Bruder Elia, der mit dem Bau der Basilika betraut war. Sie besteht aus einer dunklen, niedrigen Unterkirche mit Fresken von Simone Martini und der hoch aufstrebenden Oberkirche, die das Schauspiel eines vollendeten gotischen Baus bietet. Letztere ist mit einem Freskenzyklus von Giotto mit Szenen aus dem Leben des heiligen Franziskus geschmückt.