Außer etruskisch-römischen und frühchristlichen Funden, die unter der Kathedrale und in ihrer Umgebung entdeckt wurden, besitzt dieses Museum auch eine schöne Sammlung illuminierter religiöser Bücher aus dem 15. und 16. Jh., die aus der Abtei Monte Oliveto Maggiore stammen, sowie Werke der Goldschmiedekunst, Reliquienschreine und Ornate. Der Gang durch das Porsenna-Labyrinth, ein antikes Kanalsystem zur Wasserversorgung, beginnt im Museum und endet in der etruskisch-römischen Zisterne aus dem 2. Jh. v. Chr.