In der Stiftung sind die schönsten Stücke der außergewöhnlichen Büchersammlung vereint, der Martin Bodmer (1899-1971) sein gesamtes Leben gewidmet hat: Tafeln in Keilschrift, griechische und koptische Papyri, darunter die ältesten Manuskripte des Johannes-Evangeliums, fast 300 Inkunabeln und mehrere Hundert Manuskripte aus Orient und Okzident. Die früheren Ausstellungsräume wurden 2003 durch ein neues unterirdisches Museum ersetzt, das von dem Schweizer Architekten Mario Botta entworfen wurde (schöne Terrasse mit Blick auf den See).