Die ursprüngliche Fassade dieser Kirche, die Ende des 16. Jh. erbaut wurde, stürzte beim Erdbeben ein. Erstaunlich ist die reichhaltige Ausschmückung des Innenraums, vor allem in der São João Baptista-Kapelle, einem Meisterwerk der italienischen Barockkunst. Sie wurde 1742 in Rom erbaut, abmontiert und nach Lissabon transportiert, wo sie um 1750 wieder aufgebaut wurde. In der 3. Kapelle rechts sind Azulejos aus dem 16. Jh. zu sehen und in der Sakristei sind Szenen aus dem Leben des heiligen Franziskus zu bewundern.