Das Marinemuseum befindet sich in zwei verschiedenen Gebäuden ‒ im Westflügel des Hieronymitenklosters und im Pavillon der Galioten. Das Museum erinnert an die Vergangenheit der portugiesischen Seefahrt. Ausgestellt werden zahlreiche Schiffsmodelle: Schiffe, Fregatten, Yachten, Überseedampfer der Handelsmarine, Modelle der Kriegsmarine, Fischerboote ... Ein großer Saal ist den Entdeckungen und der Kriegsmarine vom 15. bis 18. Jh. gewidmet und zeigt ebenfalls alte Seekarten.
