Seit seiner Sanierung im Jahre 2013 hat sich dieses Museum zu einem der Highlights von Marseille entwickelt. In einem schlicht-modernen, lichtdurchfluteten Gebäude werden die stark erweiterten Sammlungen in 13 Sequenzen präsentiert, die die Entwicklung der Stadt von der Frühgeschichte bis in die heutige Zeit auf eine klare und lehrreiche Art illustrieren. Ein Muss sind das Wrack eines römischen Handelsschiffs aus dem 3. Jh., das größte ausgestellte antike Schiff der Welt, und die außergewöhnliche Grabkirche aus der Rue Malaval.