Dieses Museum enthält eine bedeutende Abteilung etruskischer und römischer Archäologie insbesondere mit bemerkenswerten Graburnen, die im Grab der Familie Cai Cutu gefunden wurden. Dieses unversehrte etruskische Grab wurde zwischen dem 3. und dem 1. Jh. v. Chr. benutzt. In der Antiquitätensammlung beachte man den Cippo perugiano (3.-2. Jh. v. Chr.), eine Steinstele, auf deren Seiten einer der längsten bis heute erhaltenen Texte in etruskischer Sprache aufgeführt ist.