Die prähistorische Abteilung des Museums präsentiert Alltagsgegenstände, die aus jungsteinzeitlichen Fundstätten in der Umgebung des Donautals stammen. In den Sälen, die die Zeit von der Antike bis zur Ankunft der Protobulgaren nachzeichnen, sind Objekte zur thrakischen Kultur sowie zu den Römern ausgestellt. Die ersten Bulgaren sind durch Waffen und durch die älteste kyrillische Inschrift der Welt vertreten. Höhepunkt des Museums ist der thrakische Schatz von Borino, sechs Stücke aus Silber (eine Vase und fünf Rhyton genannte Trinkgefäße), von denen zwei den Namen König Kotys' (383-360 v. Chr.) erwähnen.